Bakterilerde solunum enzimleri, hücre zarının sitoplazma içine katlanmasıyla oluşan mezozomlar ve sitoplazmada bulunur. Mezozomlar, ökaryot canlılarda bulunan mitokondrinin görevini yapar ve oksijenli solunum yapan bakterilerde daha çok görülür. Oksijensiz solunum yapan bakterilerde ise solunum enzimleri sadece sitoplazmada yer alır. Bakterilerde solunum enzimleri, organik molekülleri oksitleyerek ATP üretir ve enerji sağlar.