İstanbul Hükümeti Temsil Heyeti’nin hukuki varlığını ilk kez Amasya Görüşmesi ile tanımıştır. Amasya Görüşmesi, 20 Ekim 1919’da Amasya’da gerçekleşmiştir. Görüşmede İstanbul Hükümeti’ni Bahriye Nazırı Salih Paşa, Temsil Heyeti’ni ise Mustafa Kemal Paşa temsil etmiştir. Görüşme sonunda Amasya Protokolü imzalanmıştır. Amasya Protokolü, Milli Mücadele’nin siyasi ve askeri yönünü belirleyen bir metindir.