Escherichia coli bakterisinin genomu, tek bir çembersel DNA molekülü olarak hücre içerisinde bulunur. Bu DNA molekülü, yaklaşık 4.6 milyon baz çifti içerir ve yaklaşık 1200 pm uzunluğundadır. Ancak bakterinin kendisi, yaklaşık 2 pm uzunluğunda ve 0.5 pm çapındadır. Bu durumda, E. coli genomunun hücre içerisine nasıl sığabildiği sorusu akla gelir.
E. coli genomunun hücre içerisine sığabilmesi için, DNA molekülünün çok kuvvetli bir şekilde sarılarak ve katlanarak kompakt bir yapı oluşturması gerekir. Bu işlem, DNA molekülünün üzerinde bulunan supercoil adı verilen özel proteinler tarafından gerçekleştirilir. Supercoil proteinleri, DNA molekülünü bükerek ve kıvırarak daha küçük bir hacme indirger. Böylece, E. coli genomu, hücre içerisinde nükleoid adı verilen bir bölgeye yerleşir.
Nükleoid bölgesi, E. coli hücresinin yaklaşık %20’sini kaplar ve sitoplazmadan ayrılmış bir zarla çevrili değildir. Nükleoid bölgesi, DNA molekülünün yanı sıra RNA ve proteinleri de içerir. Nükleoid bölgesinin yapısı ve organizasyonu, E. coli’nin gen ekspresyonu ve replikasyonu için önemlidir.
E. coli genomunun hücre içerisine sığabilmesinin temel mekanizması budur.
