Transgenik bitkiler üreterek artan dünya nüfusunun gıda probleminin önüne geçilmesinde olumsuz etkileri şunlar olabilir:
-
Transgenik bitkilerin insan, hayvan ve çevre sağlığı üzerinde uzun vadeli etkileri henüz tam olarak bilinmemektedir. Transgenik bitkilerden alınan gıdaların tüketilmesi sonucu gıda alerjileri, toksin birikimi, antibiyotik direnci gibi sorunlar ortaya çıkabilir.
-
Transgenik bitkilerin doğal bitki çeşitliliğini azaltması, genetik erozyona yol açması, yabani bitkilere gen aktarımı sonucu istenmeyen özellikler kazandırması, ekosistem dengesini bozması gibi çevresel riskler taşımaktadır.
-
Transgenik bitkilerin zararlılara karşı dayanıklılığı zamanla azalabilir, yeni zararlı türlerinin ortaya çıkmasına veya mevcut zararlıların direnç kazanmasına neden olabilir.
-
Transgenik bitkilerin doğal düşmanlara olan etkisi de önemli bir konudur. Transgenik bitkilerden beslenen böceklerin doğal düşmanlarına da zarar verebilir, biyolojik mücadele yöntemini etkileyebilir.
-
Transgenik bitkilerin ticari ve yasal boyutları da dikkate alınmalıdır. Transgenik bitki üretimi yapan ülkeler arasında ticari rekabet, patent hakları, etiketleme, izlenebilirlik gibi konularda anlaşmazlıklar yaşanabilir.