Menstrual döngüyü kontrol eden hipofiz hormonları, FSH (folikül uyarıcı hormon) ve LH (lüteinleştirici hormon) olarak adlandırılır. Bu hormonlar, yumurtalıklarda folikül ve yumurta gelişimini, östrojen ve progesteron salgılanmasını, yumurtlama olayını ve döl yatağı hazırlığını etkiler. FSH ve LH, hipotalamustan salgılanan GnRH (gonadotropin salgılatıcı hormon) tarafından uyarılır.