Çimlenme, tohumda bulunan embriyonun uygun şartlar bulunca gelişerek ana bitkiye benzer bitkiyi vermek üzere tohumdan çıkarak serbest hale geçmesine denir. Çimlenme için gerekli şartlar su, sıcaklık ve oksijendir. Su, tohumun kabuğunu yumuşatır ve embriyonun büyümesi için gerekli olan kimyasal reaksiyonları başlatır. Sıcaklık, tohumun içindeki enzimlerin çalışmasını sağlar ve embriyonun metabolizmasını artırır. Oksijen, tohumun solunum yaparak enerji üretmesini ve yedek besin maddelerini kullanmasını sağlar. Çimlenme sırasında embriyo, kökçük, çenek yapraklar ve sürgün oluşturur. Kökçük, tohumdan ilk çıkan kısımdır ve topraktan su ve mineralleri alır. Çenek yapraklar, tohumun içindeki yedek besin maddelerini depolar ve fotosentez yapar. Sürgün, çenek yaprakların üzerinde bulunan büyüme noktasıdır ve yeni yapraklar, dallar ve çiçekler oluşturur.
