Lizozom zarı zarar görürse, içindeki sindirici enzimler sitoplazmaya dağılır ve hücrenin kendini sindirmesine neden olur. Bu olaya otoliz denir. Otoliz, hücrenin ölümüne yol açabilir. Bazı durumlarda, hücreler otolizi kontrollü bir şekilde başlatır ve buna programlanmış hücre ölümü denir. Programlanmış hücre ölümü, hücrenin yaşlanması, hasarı veya enfeksiyonu gibi nedenlerle hücrenin işlevini kaybetmesi durumunda gerçekleşir. Programlanmış hücre ölümü, hücrenin çevresine zarar vermeden temizlenmesini sağlar.