Atom numarası ile kütle numarası arasındaki fark, bir elementin çekirdeğindeki proton ve nötronların farklı sayılarını ifade etmeleridir. Atom numarası sadece proton sayısını ifade ederken, kütle numarası proton ve nötron sayısının toplamını ifade eder. Atom numarası, elementi tanımlar ve Z harfi ile gösterilir. Kütle numarası ise A harfi ile gösterilir. Örneğin, karbon-12 atomunun atom numarası 6, kütle numarası ise 12’dir.