Alel, belirli bir özelliği belirleyen bir genin değişik (alternatif) hallerinden her biridir. Örneğin, göz rengini belirleyen genin kahverengi, mavi, yeşil gibi farklı alelleri olabilir. Alel sözcüğü, özellikle bir kromozomun bir lokusundaki iki ya da daha fazla seçenekli gen çeşidini anlatmak için kullanılır. Aleller, büyük veya küçük harflerle gösterilir. Örneğin, A, a, B, b gibi. Aleller, baskın veya çekinik olabilir. Baskın aleller, heterozigot durumda fenotipte kendini gösterirken, çekinik aleller sadece homozigot durumda fenotipte kendini gösterir. Örneğin, kahverengi göz rengi aleli (A), mavi göz rengi aleline (a) baskındır. Bu durumda, Aa genotipine sahip bir bireyin fenotipi kahverengi göz rengidir.
