Histon proteinleri, ökaryotik hücrelerde bulunan ve DNA’yı kromatin iplik haline getiren bazik proteinlerdir. Toplamda 5 çeşit histon proteini bulunmaktadır. Bunlar H1, H2A, H2B, H3 ve H4 şeklindedir. Şunu da belirtelim ki DNA zincirinin her yerinde histon proteini bulunmaz.
Histon proteinleri, DNA’nın etrafında sarılarak nükleozom adı verilen yapı birimlerini oluştururlar. Her bir nükleozomda 8 adet histon proteini vardır. Bunlar H2A, H2B, H3 ve H4 isimli histon proteinlerinin her birinden ikişer tanedir. Nükleozomlar arasında ise H1 isimli histon proteini bulunur ve nükleozomları bir arada tutar.
Histon proteinleri, DNA’nın kromatin iplik halinde sıkıca paketlenmesini sağlarlar. Böylece DNA’nın hasar görmesini önler, gen ifadesini düzenler ve hücre bölünmesi sırasında kromozomların oluşmasını mümkün kılarlar.