Doku uyumu, bir kişinin vücudundaki hücrelerin kendine özgü bir protein grubu olan insan lökosit antijeni (HLA) ile tanımlanmasıdır. HLA proteinleri, vücudun kendi hücrelerini yabancı hücrelerden ayırt etmesine yardımcı olur. Kök hücre nakli yapılacak kişi ile verici arasında HLA uyumu olması gerekir. Bu durum, bağışıklık sisteminin nakledilen kök hücreleri reddetme riskini azaltır. HLA uyumu, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1 ve HLA-DQ gibi farklı belirteçlere göre belirlenir. HLA belirteçleri, anne ve babadan kalıtımla geçer. Bu nedenle akraba vericilerden elde edilen kök hücre kaynakları, alıcı ile daha iyi eşleşir. Kordon kanında ise doku uyumu daha esnek olabilir. Doku uyumu ne kadar iyi olursa, nakil sonrası komplikasyonlar o kadar az olur.
