Fermantasyon sırasında enerji verici olarak kullanılan moleküller şunlardır:
-
Glikoz: Fermantasyonun başlangıç substratıdır. Glikoz, glikoliz yoluyla piruvata dönüştürülür ve bu sırada iki ATP ve iki NADH molekülü üretilir.
-
Piruvat: Glikolizin son ürünüdür. Piruvat, farklı mikroorganizmalara göre farklı son ürünlere dönüşebilir. Örneğin, mayalar pirüvattan etanol ve karbondioksit üretirken, laktik asit bakterileri pirüvattan laktik asit üretir. Piruvatın son ürünlere dönüşmesi sırasında enerji üretilmez, ancak NAD + molekülünün yenilenmesi sağlanır.
-
NADH: Glikolizde oluşan elektron taşıyıcı moleküldür. NADH, fermantasyonun son adımında elektronlarını piruvata veya ondan türemiş bir bileşiğe verir ve NAD + molekülüne dönüşür. NAD + tekrar kullanılmak üzere glikolize gönderilir.