Doğu Anadolu Bölgesi, beş bölüme ayrılır. Bunlar şunlardır:
-
Erzurum-Kars Bölümü: Bölgenin kuzeyinde yer alan ve Erzurum, Kars, Ağrı, Iğdır ve Ardahan illerini kapsayan bölümdür. Yalnızçam, Allahuekber, Kop ve Çimen dağları ile Erzurum-Kars platosu bu bölümde yer alır.
-
Yukarı Fırat Bölümü: Bölgenin batısında yer alan ve Erzincan, Tunceli, Elazığ, Malatya, Bingöl ve Muş illerini kapsayan bölümdür. Munzur, Karasu ve Murat ırmakları ile Hazar, Balık ve Bulanık gölleri bu bölümde yer alır.
-
Yukarı Murat-Van Bölümü: Bölgenin güneyinde yer alan ve Bitlis, Van ve Hakkari illerini kapsayan bölümdür. Nemrut, Süphan, Ağrı ve Tendürek dağları ile Van Gölü ve Erçek Gölü bu bölümde yer alır.
-
Hakkari Bölümü: Bölgenin güneydoğusunda yer alan ve Hakkari ilini kapsayan bölümdür. Cilo ve Sat dağları ile Zap Suyu bu bölümde yer alır.
-
Malatya-Elazığ-Tunceli Bölümü: Bölgenin kuzeybatısında yer alan ve Malatya, Elazığ ve Tunceli illerini kapsayan bölümdür. Karakaya Baraj Gölü bu bölümde yer alır.