Comte’nin pozitivizmi, sadece bilimsel bilginin gerçek bilgi olduğunu ve metafizik spekülasyonların dışında bırakılması gerektiğini savunuyordu. Bu bakış açısına göre, gözlemlenebilir olmayan şeyler gerçek olarak kabul edilmemelidir. Ancak, nötrino ve kuark gibi atom altı parçacıkların gözlemlenebilir olmadığı anlamına gelmez. Bu parçacıklar, çeşitli dedektörler kullanılarak dolaylı olarak tespit edilebilir. Örneğin, nötrinolar, atom çekirdekleriyle etkileşime girerek Çerenkov ışınımı yayan yüklü leptonlar üretebilir. Bu ışınım, gelen nötrinoların yönü, enerjisi ve bazen de lezzeti hakkında bilgi verir. Kuarklar da benzer şekilde, çarpıştırıcılar gibi yüksek enerjili ortamlarda üretilebilir ve jetler adı verilen parçacık demetleri şeklinde algılanabilir.
Bu nedenle, nötrino ve kuarkların gerçek olmadığını söylemek yanlış olur. Sadece gözlemlenmesi zor olan parçacıklardır. Comte’nin pozitivizmi ise, bilimin sınırlarını çok daraltan ve metafizik sorulara yer vermeyen bir felsefedir. Günümüzde, fizikçiler hem deney hem de teori yoluyla atom altı parçacıkların doğasını anlamaya çalışmaktadır. Bu süreçte, gözlemlenebilir olmayan kavramlar da önemli bir rol oynamaktadır. Örneğin, kuantum mekaniği ve sicim teorisi gibi teoriler, gözlem verilerine uygun olmakla birlikte, aynı zamanda metafizik varsayımlar da içermektedir. Bu teorilerin gerçekliği ise henüz kesin olarak kanıtlanmamıştır.
