Mikroorganizmaların canlı veya cansız ortama bulaşmasına enfekte denir. Enfekte olan canlı veya ortam, enfeksiyon geçirmiş veya enfeksiyon kaynağı olmuş demektir.
Mikroorganizmalar, çıplak gözle görülemeyecek kadar küçük ve tek hücreli canlılardır. Bakteriler, mayalar, küfler, algler ve protozoa temel mikroorganizmalardır. Mikroorganizmalar, biyosferin her yerinde yaşamaktadır. Bazı mikroorganizmalar, ekosistemlerin besin çemberinde ve azot döngüsünde önemli rol oynarlar. Bazı mikroorganizmalar da biyoteknoloji ve gıda üretiminde yararlıdır. Ancak bazı mikroorganizmalar, patojenik yani hastalık yapıcıdır. Bu mikroorganizmalar, diğer canlılara girerek içlerinde çoğalır ve zarar verirler. Bu durumda, enfeksiyon hastalıklarından korunmak için hijyen kurallarına uymak ve gerekli aşıları yaptırmak önemlidir.