Milli cemiyetlerin en önemli özelliği, ülkenin işgaline karşı kurulmuş olmaları ve bağımsızlığı savunmalarıdır. Bu cemiyetler bölgesel olarak ortaya çıkmıştır ve her biri kendi bölgesini savunmayı hedeflemiştir. Örneğin, Trabzon ve çevresini savunmak için Trabzon Muhafaza-i Hukuk-ı Milliye Cemiyeti kurulmuştur. Bu cemiyetlerin bir başka özelliği de tamamen Türkler tarafından, yani Anadolu insanı tarafından kurulmuş olmasıdır. Bu cemiyetler, İstanbul Hükümeti'ne güvenmedikleri için kendi başlarına örgütlenmişlerdir.
Milli cemiyetlerin temel amacı, işgallere karşı çıkmak ve toprak bütünlüğünü sağlamaktır. Azınlıkların kurduğu zararlı cemiyetlerin faaliyetlerini de engellemeye çalışmışlardır. Kuvâ-yı Milliye hareketinin oluşmasına ve güçlenmesine katkı sağlamışlardır. Sivas Kongresi'nde tüm milli cemiyetler Anadolu ve Rumeli Müdafaa-i Hukuk Cemiyeti adı altında birleştirilerek tek bir çatı altında toplanmıştır. Bu birleşme ile milli mücadele daha güçlü bir hale gelmiştir.