Hücreler genel olarak iki ana tipte ayrılır: prokaryotik ve ökaryotik hücreler. Prokaryotik hücreler, çekirdek zarı ve zarlı organelleri olmayan basit ve ilkel hücrelerdir. Bakteriler, arkebakteriler ve mavi-yeşil algler prokaryotik hücrelere örnektir. Ökaryotik hücreler, çekirdek zarı ve zarlı organelleri olan gelişmiş ve karmaşık hücrelerdir. Hayvanlar, bitkiler, mantarlar ve protistler ökaryotik hücrelere örnektir.
Ökaryotik hücreler kendi içinde farklı gruplara ayrılabilir. Örneğin, bitki hücreleri plastit ve hücre duvarı gibi hayvan hücrelerinde bulunmayan organeller içerir. Hayvan hücreleri ise sentrozom gibi bitki hücrelerinde bulunmayan bir organel içerir. Ayrıca, dokuların yapısına ve fonksiyonuna göre değişen farklı hücre tipleri vardır. Örneğin, kemik hücreleri, kan hücreleri, kas hücreleri, sinir hücreleri gibi.
