Bağırsaktan geçen maddelerin yönü, bağırsak duvarının içinden dışına doğrudur. Yani, bağırsak lümeninden kan damarlarına veya lenf damarlarına doğru geçerler. Geçiş yönünü belirleyen etken ise, bağırsak lümeni ile bağırsak duvarı arasındaki konsantrasyon farkıdır. Maddeler, konsantrasyonu yüksek olan ortamdan konsantrasyonu düşük olan ortama doğru hareket ederler. Bu hareketin gerçekleşmesi için farklı mekanizmalar vardır. Örneğin, basit difüzyon, kolaylaştırılmış difüzyon, aktif taşıma ve osmoz gibi.