Ekoton, farklı ekosistemlerin kesişme bölgeleridir. Ekotonlar, farklı bölgelerin özelliklerinin hepsini taşıdıkları için tür çeşitliliği çok fazladır. Ekotonlar, genellikle kenarlar olarak da bilinen nispeten keskin, yerel geçişleri ifade eder. Örneğin, bir tarla ile orman arasındaki bölge veya orman ve otlak ekosistemleri arasındaki geçiş birer ekoton örneğidir.
Ekotonlar, hem biyotik hem de abiyotik faktörlerden etkilenir. Biyotik faktörler, bir ekosistemin canlı bileşenleridir. Abiyotik faktörler ise, bir ekosistemin cansız bileşenleridir. Biyotik faktörler arasında rekabet, predasyon, mutualizm, komensalizm ve parazitizm gibi etkileşimler vardır. Abiyotik faktörler arasında iklim değişikliği, doğal afetler, kirlilik ve erozyon gibi olaylar vardır.