Mikroskobik canlılar, gözle görülemeyen ancak mikroskopla incelenebilen canlılardır. Mikroskobik canlılar çok çeşitli ve zengin bir grup oluştururlar. Bakteriler, mantarlar, arkealar, protistler, mikroskobik bitkiler ve hayvanlar mikroskobik canlılara örnek olarak verilebilir. Mikroskobik canlılar, suda, havada, toprakta, diğer canlıların vücudunda ve hemen her yerde yaşayabilirler. Bazı mikroskobik canlılar yararlı, bazıları ise zararlıdır. Yararlı mikroskobik canlılar, besinlerin mayalanmasında, toprağın verimliliğinde, bağışıklık sisteminde ve ilaç üretiminde rol oynarlar. Zararlı mikroskobik canlılar ise hastalıklara, besinlerin bozulmasına ve çürümesine neden olurlar.